أنشئت دائرة النقل بموجب قانون رقم 4 لسنة 2006 لممارسة الرقابة الإشرافية على قطاع الموانئ البحرية وإصدار الأنظمة والقرارات اللازمة لضمان حسن سير العمل في قطاع الموانئ.
لممارسة سلطتها تقوم دائرة النقل بتسهيل عملية تطوير نظام ملاحة بحرية متكامل وفعال يخدم المصلحة العامة عن طريق إيجاد صيغة عمل تتسم بالأمن والسلامة والمسؤولية الاقتصادية والبيئية لقطاع الملاحة البحرية في إمارة أبوظبي.  

بالإضافة لدورها في الإشراف التنظيمي، تأخذ دائرة النقل على عاتقها وضع السياسات التطويرية والخطط الإستراتيجية، وكذلك مراقبة وإدارة الأداء في قطاع الموانئ. ومن أهم أهداف الدائرة ضمان سلامة الإبحار وعمليات الشحن البحري وذلك عن طريق رفع مستوى معايير الأمن والسلامة، وتعزيز عوامل الجذب في موانئ أبوظبي التجارية، وحماية الصالح العام، وتشجيع روح التنافس، وضمان حماية البيئة البحرية ، وتحقيق التكامل الفعال بين الموانئ البحرية وغيرها من أساليب النقل الأخرى